Séquençage métagénomique shotgun haut débit pour des échantillons d'ADN environnementaux. Ces ADN proviennent d'échantillons de sol de la rhizosphère de plantes. Au cours du projet, au moins 250 échantillons d'ADN environnementaux seront séquencés. Les échantillons fournis seront de l’ADNg déjà extrait.\nLa majorité des échantillons (au minimum 250 échantillons) fera l’objet d’un seul envoi, mais d’autres envois pourront intervenir ultérieurement. \nUne approche de séquençage par lecture courte est souhaitée. La technologie de séquençage souhaitée est Illumina NovaSeq X 2*150 pb paired-end, ou mieux Aviti 2*150 pb paired-end. Les librairies devront utiliser des tailles de fragments de 350 pb. Le nombre de séquences souhaité par librairie est de 50 millions de lectures appairées.\n

Publié le : 02/06/2024